गुणवत्ता नियंत्रण गतिविधियाँ: गुणवत्ता और सुरक्षा किसी भी खाद्य प्रसंस्करण उद्योग की नींव है। समुद्री खाद्य उद्योग में, उष्णकटिबंधीय परिस्थितियों के कारण, गुणवत्ता नियंत्रण एक बहुत ही महत्वपूर्ण तत्व है क्योंकि संसाधित उत्पादों की गुणवत्ता प्रकृति में अत्यधिक विषमरुप और नाशवान है।  इसे महसूस करते हुए, एमपीईडीए ने उद्योग को समुद्री खाद्य की गुणवत्ता की सुरक्षा के लिए पर्याप्त गुणवत्ता नियंत्रण उपायों के साथ हैंडलिंग, प्रसंस्करण के आधुनिक तरीकों को अपनाने की सलाह दी।

सुरक्षित भोजन की लगातार बढ़ती मांग का सामना करने और विश्व भर में स्वास्थ्य और गुणवत्ता के प्रति जागरूक उपभोक्ताओं की जरूरतों को पूरा करने के लिए, एमपीईडीए गुणवत्ता नियंत्रण अनुभाग ने विकास / सुधार के लिए निम्नलिखित प्रमुख क्षेत्रों की पहचान की और कार्यक्रमों को निम्नानुसार लागू किया:


    1.  एमपीईडीए ने कोच्चि, भीमावरम, नेल्लोर, भुवनेश्वर और पोरबंदर में प्रयोगशालाएं स्थापित की हैं, जिनमें उन्नत प्रौद्योगिकी का उपयोग करते हुए भारी धातुओं, रंगों, कीटनाशकों और एंटीबायोटिक अवशेषों के लिए समुद्री खाद्य के नमूनों का परीक्षण करने की सुविधा है।
    2. यह निर्यात के लिए एंटीबायोटिक अवशेष मुक्त जलकृषि श्रिम्प सुनिश्चित करने के लिए एलिसा प्रयोगशालाओं के राष्ट्रव्यापी नेटवर्क का संचालन कर रहा है।
    3. गुणवत्ता उन्नयन के लिए समुद्री खाद्य उद्योग को तकनीकी जानकारी और सूचना प्रदान करना।
    4. आवश्यकता पड़ने पर राष्ट्रीय अनुसंधान संस्थानों के साथ गुणवत्ता की समस्याओं पर विशेष अनुसंधान परियोजनाओं को सौंपना
    5. गुणवत्ता आश्वासन प्राप्त करने के लिए मिनी प्रयोगशालाओं की स्थापना के लिए सहायता प्रदान करके समुद्री खाद्य की गुणवत्ता के उन्नयन के लिए एकीकृत विकास कार्यक्रम।
    6. ऐसे देशों द्वारा समय-समय पर निर्धारित/संशोधित मानकों/मानदंडों/विनियमों के आधार पर विभिन्न देशों को मत्स्य और मत्स्य उत्पादों के निर्यात के अनुपालन के लिए मानकों का प्रसार करना।
    7. प्रौद्योगिकी के क्षेत्र में नवीनतम विकास से परिचित कराने के लिए भारत के प्रतिनिधिमंडलों की व्यवस्था करना और गुणवत्ता संबंधी मुद्दों को हल करना, यदि कोई हो।
    8. जब भी आवश्यक हो, एमपीईडीए भारत में आयात करने वाले देशों के स्वास्थ्य अधिकारियों द्वारा भारत में मत्स्य और मत्स्य उत्पादों के प्रसंस्करण और संचालन में हुए सुधारों का निरीक्षण करने के लिए भारत में यात्राओं / निरीक्षणों को आमंत्रित करता है । तथा भारत में अपनाई जा रही प्रसंस्करण और निरीक्षण प्रणाली का पालन करता है।
    9. एमपीईडीए भारतीय मानक ब्यूरो, निर्यात निरीक्षण परिषद और भारतीय खाद्य सुरक्षा और मानक प्राधिकरण द्वारा आयोजित बैठकों में एक सदस्य है। एमपीईडीए कोडेक्स एलिमेंटेरियस कमीशन की विभिन्न समितियों में भारत के रुख को अंतिम रूप देने के लिए एनसीसीपी द्वारा आयोजित बैठकों में भी अपनी टिप्पणियां प्रस्तुत करता है, जहां मत्स्य और मत्स्य उत्पादों और संबंधित विषयों के लिए अंतरराष्ट्रीय मानक तैयार किए जाते हैं।
  1. एसपीएस/टीबीटी मुद्दों पर टिप्पणियां प्रदान करना।
  2. भविष्य में पुनरावृत्ति को रोकने के लिए संसाधक को सुधारात्मक कार्रवाई का सुझाव देने के लिए यूरोपीय संघ, जापान, यूएसएफडीए और अन्य बाजारों से रिपोर्ट किए गए अस्वीकृति/अवरोध की जांच करें।
  3. एचएसीसीपी कार्यान्वयन के लिए तकनीकी मार्गदर्शन प्रदान करना।
  4. आयातक देशों द्वारा अपनाई गई विश्लेषणात्मक विधियों से परिचित कराने के

लिए समुद्री खाद्य प्रसंस्करण क्षेत्र के लिए गुणवत्ता नियंत्रण में राष्ट्रीय/अंतर्राष्ट्रीय प्रशिक्षण आयोजित करना। यूएसएफडीए, ईयू-बीटीएसएफ, सीआईटीडी, एफएओ, इन्फोफिश आदि जैसे राष्ट्रीय और अंतर्राष्ट्रीय संगठनों के सहयोग से भारत में प्रशिक्षण कार्यक्रम आयोजित किए जाते हैं।