समुद्री उत्पादों के निर्यात में उत्कृष्ट प्रदर्शन के लिए एमपीईडीए निर्यात पुरस्कार 1990 में प्रारम्भ किए गए थे। पाँच अलग-अलग श्रेणियों और उपश्रेणियों के तहत दो सर्वोत्तम निर्माता-निर्यातकों को पुरस्कार दिये जाते हैं। प्राधिकरण की निर्यात संवर्धन समिति (ईपीसी ) द्वारा नियम, शर्त और पुरस्कार के लिए पात्रता के मानदंड का निर्णय लिया जाता है। ईपीसी द्वारा नियत मानदंड के अनुसार प्रत्येक श्रेणी के सर्वोच्च 10 निर्यातकों की सूची तैयार की जाती है । श्रेणियां जिसके तहत पुरस्कार दिए जाते हैं, इस प्रकार हैं:
| श्रेणी I | (ए) मूल्य में सबसे ज्यादा निर्यात वाले निर्माता निर्यातक। |
(बी) मात्र में सबसे ज्यादा निर्यात वाले निर्माता निर्यातक। | |
| श्रेणी II | प्रमुख उत्पाद समूहों में सबसे ज्यादा निर्यात करने वाले निर्माता निर्यातक |
प्रमुख उत्पाद समूहों में सबसे ज्यादा निर्यात वाले निर्माता निर्यातक:
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| श्रेणी III | एक्वैरियम मत्स्य के अलावा अन्य जीवित समुद्री खाद्य के निर्यातक |
| श्रेणी IV | एक्वैरियम मत्स्य के निर्यातक |
| श्रेणी V | निम्नलिखित क्षेत्रों में हासिल उपलब्धियों को ध्यान में रखते हुए विशेष प्रयासों के लिए पुरस्कार
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| श्रेणी VI | वर्ष के सबसे जिम्मेदार निर्यातक के लिए अध्यक्ष का विशेष पुरस्कार |
| श्रेणी VII | लाइफटाइम अचीवमेंट पुरस्कार |